消毒藥品種類繁多，按其性質可分為：醇類、碘類、酸類、堿類、鹵素類、酚類、氧化劑類、揮發性烷化劑類等，下面主要介紹畜禽飼養場常用的幾種消毒藥：
1. 氫氧化鈉(又稱苛性鈉、燒堿或火堿)：堿類消毒劑，粗制品為白色不透明固體，有塊、片、粒、棒等形狀；成溶液狀態的俗稱液堿，主要用于場地、欄舍等消毒。2―4%溶液可殺死病毒和繁殖型細菌，30%溶液10分鐘可殺死芽孢，4%溶液45分鐘殺死芽孢，如加入10%食鹽能增強殺芽孢能力。實踐中常以2%的溶液用于消毒，消毒1―2小時后，用清水沖洗干凈。
2. 石灰(生石灰)：堿類消毒劑，主要成分是CaO，加水即成氫氧化鈣，俗名熟石灰或消石灰，具有強堿性，但水溶性小，解離出來的氫氧根離子不多，消毒作用不強。1%石灰水殺死一般的繁殖型細菌要數小時，3%石灰水殺死沙門氏菌要1小時，對芽孢和結核菌無效。其最大的特點是價廉易得。實踐中，20份石灰加水到100份制成石灰乳，用于涂刷墻體、欄舍、地面等，或直接加石灰于被消毒的液體中，或撒在陰濕地面、糞池周圍及污水溝等處消毒。
3. 賽可新(Selko-pH)：酸類消毒劑，主要成分是復合有機酸，用于飲水消毒，用量為每升飲水添加1.0―3.0毫升。
4. 農福：酸類消毒劑，由有機酸、表面活性劑和高分子量殺微生物劑混合而成。對病毒、細菌、真菌、支原體等都有殺滅作用。常規噴霧消毒作1：200稀釋，每平方米使用稀釋液300毫升；多孔表面或有疫情時，作1：100稀釋，每平方米使用稀釋液300毫升；消毒池作1：100稀釋，至少每周更換一次。
5. 醋酸：酸類消毒劑，用于空氣熏蒸消毒，按每立方米空間3―10毫升，加1―2倍水稀釋，加熱蒸發。可帶畜、禽消毒，用時須密閉門和窗。市售酸醋可直接加熱熏蒸。
6. 漂白粉：鹵素類消毒劑，灰白色粉末狀，有氯臭，難溶于水，易吸潮分解，宜密閉、干燥處儲存。殺菌作用快而強，價廉而有效，廣泛應用于欄舍、地面、糞池、排泄物、車輛、飲水等消毒。飲水消毒可在1000公斤河水或井水中加6―10克漂白粉，10―30分鐘后即可飲用；地面和路面可撒干粉再灑水；糞便和污水可按1：5的用量，一邊攪拌，一邊加入漂白粉。
7. 二氧化氯消毒劑：鹵素類消毒劑，是國際上公認的新一代廣譜強力消毒劑，被世界衛生組織列為A1級高效安全消毒劑，殺菌能力是氯氣的3-5倍；可應用于畜禽活體、飲水、鮮活飼料消毒保鮮、欄舍空氣、地面、設施等環境消毒、除臭；本品使用安全、方便，消殺除臭作用強，單位面積使用價格低。
8. 消毒威(二氯異氰尿酸鈉)：鹵素類消毒劑，使用方便，主要用于養殖場地噴灑消毒和浸泡消毒，也可用于飲水消毒，消毒力較強，可帶畜、禽消毒。使用時按說明書標明的消毒對象和稀釋比例配制。
9. 二氯異氰尿酸鈉煙熏劑：鹵素類消毒劑，本品用于養蠶消毒及畜禽欄舍、飼養用具的消毒；使用時，按每立方米空間2―3克計算，置于畜禽欄舍、蠶室中，關閉門窗，點燃后即離開，密閉24小時后，通風換氣即可；還可用于蘑菇房、蔬菜大棚消毒。
10. 氯毒殺：鹵素類消毒劑，使用同消毒威。
11. 百毒殺：雙鏈季銨鹽廣譜殺菌消毒劑，無色、無味、無刺激和無腐蝕性，可帶畜、禽消毒。配制成萬分之三或相應的濃度用于畜禽圈舍、環境、用具、種蛋、孵化室的消毒，萬分之一的濃度用于飲水消毒。
12. 東立銨碘：雙鏈季銨鹽、碘復合型消毒劑，對病毒、細菌、霉菌等病原體都有殺滅作用。可供飲水、環境、器械、畜禽和種蛋等消毒；飲水、噴霧、浸泡作1：2000―2500稀釋，發病時作1：1000―1250稀釋。
13. 菌毒滅：復合雙鏈季銨鹽滅菌消毒劑，具有廣譜、高效、無毒等特點，對病毒、細菌、霉菌及支原體等病原體都有殺滅作用；飲水作1：1500―2000稀釋；日常對環境、欄舍、器械消毒(噴霧、沖洗、浸泡)作1：500―1000稀釋；發病時作300倍稀釋。
14. 福爾馬林：醛類消毒劑，是含37―40%的甲醛水溶液，有廣譜殺菌作用，對細菌、真菌、病毒和芽孢等均有效，在有機物存在的情況下也是一種良好的消毒劑，缺點是有刺激性氣味。以2―5%水溶液用于噴灑墻壁、地面、料槽及用具消毒；房舍熏蒸按每立方米空間用福爾馬林30毫升，置于一個較大容器內(至少10倍于藥品體積)，加高錳酸鉀15克，事前關好所有門窗，密閉熏蒸12―24小時，再打開門窗去味。熏蒸時室溫最好不低于15攝氏度，相對濕度在70%左右。
15. 過氧乙酸：氧化劑類消毒劑，純品為無色澄明液體，易溶于水，是強氧化劑，有廣譜殺菌作用，作用快而強，能殺死細菌、霉菌芽孢及病毒，不穩定，宜現配現用。0.04―0.2%溶液用于耐腐蝕小件物品的浸泡消毒，時間2―120分鐘；0.05―0.5%或以上噴霧，噴霧時消毒人員應戴防護目鏡、手套和口罩，噴后密閉門窗1―2小時；用3―5%溶液加熱熏蒸，每立方米空間2―5毫升，熏蒸后密閉門窗1―2小時。

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